温度对杀菌灭藻剂杀菌效力的影响，可通过以下的方式起作用：
温度升高有利于在作用点上的杀菌灭藻剂与菌体代谢中间产物之间的生物化学反应，加速了杀菌灭藻剂效力的发挥。

已经有实验证明，苯酚对副伤寒杆菌的杀菌力，温度每增加10℃，杀菌力增强2~3倍。    

当温度升高时，增加了微生物细胞原生质膜的通透性，甚至会对膜造成损伤，使杀菌灭藻剂更容易进入作用部位；     
温度升高，杀菌灭藻剂的穿透能力增强，扩散速度加快，便于迅速通过障碍，到达作用部位。