微污染水源是指水的物理、化学和微生物指标已不能达到<地表水环境质量标准》GB 3838-2002中作为生活饮用水源水的水质要求。水体中污染物单项指标，如浑浊度、色度、臭味、硫化物、氮氧化化物、有毒有害的物质（如重金属汞、锰、铬、铅、砷等）、病原微生物等有超标（Ⅲ类）现象，多数情况下是受有机物微量污染的水源。水体微污染现象对饮用水处理工艺的选用造成了很大的困难。
    近年来，我国微污染水源水质主要显示以下特点。
    ①表示有机物的综合指标，如COD、BOD、TOC等值升高；水源水中这些指标值越大，说明水中有机物越多，污染越严重。例如水源水的溶解氧一般在5～10mg/L之间，如降低到5 mg/L以下时，作为饮用水源已不合适。又如当水源水的BOD小于3 mg/L时，水质较好，到5～7 mg/L时，水质较差，如超过10 mg/L时，水质极差，此时水中溶解氧已接近为零。
    ②氨氮(NH3-N)浓度升高。
    ③臭味明显。
    ④致突变的Ames试验结果呈阳性，而水质良好的水源应呈阴性。