循环水系统中常用的杀菌灭藻剂主要有以下几类：
　　1、过氧化物杀菌剂：双氧水、过氧乙酸等.
　　2、唑啉类：异噻唑啉酮、苯并异噻唑啉酮等. 　
　　3、醛类：戊二醛等

        4、含氯杀菌剂：次氯酸钠、二氧化氯、二氯异氰尿酸钠（优氯净）、三氯异氰尿酸(氯锭、强氯精）等。　
　　5、季铵盐类杀菌剂：十二烷基二甲基苄基氯化铵(1227)、十四烷基二甲基苄基氯化铵(1427)、十八烷基二甲基苄基氯化铵(1827)、聚季铵盐等.

工业循环冷却水中杀菌灭藻剂应用不可少。